iPhone 6S имеет дизайн, аналогичный iPhone 6, но включает в себя обновленное оборудование, в том числе усиленный корпус из алюминиевого сплава серии 7000 и модернизированную систему Apple A9 на кристалле, новую 12-мегапиксельную заднюю камеру, которая может записывать видео до 4K со скоростью 30 кадров в секунду. впервые в серии может делать динамические «живые фотографии», первое увеличение разрешения фотографий на фронтальную камеру со времен iPhone 5 2012 года, а также впервые имеет фронтальную вспышку Retina Flash, которая делает дисплей ярче в три раза по сравнению с его максимально возможная яркость для селфи, датчик распознавания отпечатков пальцев Touch ID 2-го поколения, расширенная поддержка LTE и функция «Привет, Siri» без необходимости подключения к сети. В iPhone 6S также представлена новая аппаратная функция, известная как «3D Touch», которая позволяет нажимать -чувствительный сенсорный ввод. iPhone 6S и iPhone 6S Plus также являются первыми смартфонами, использующими самую быструю флеш-память высокого класса NVM Express (NVMe). 6S и 6S Plus, наряду с SE 1-го поколения, являются единственными iPhone, которые поддерживаются 7-ю основными версиями iOS, от iOS 9 до iOS 15.7.3.
iPhone 6S получил в целом положительные отзывы. В то время как производительность и качество камеры были высоко оценены большинством обозревателей, добавление 3D Touch понравилось одному критику за потенциал совершенно нового взаимодействия с интерфейсом, но не понравилось другому критику за то, что он не предоставил пользователям ожидаемого интуитивного ответа до фактического использования этой функции. Есть небольшой скол возле кнопки.